在傳統(tǒng)水產(chǎn)養(yǎng)殖中，隨著魚類排泄物的積累，水體中的氨氮增加，毒性逐漸增加，在魚蔬菜共生系統(tǒng)中，養(yǎng)殖水被輸送到水培系統(tǒng)，水中的氨氮被微生物細菌分解為亞硝酸鹽和硝酸鹽堿，然后被植物吸收利用作為營養(yǎng)。

       由于水培和水產(chǎn)養(yǎng)殖技術(shù)是魚菜共生技術(shù)的基石，魚類蔬菜共生通過將不同模式的水培和水產(chǎn)養(yǎng)殖技術(shù)相結(jié)合，可以產(chǎn)生多種類型的系統(tǒng)。

       直接漂浮法利用泡沫板等漂浮體將蔬菜幼苗直接固定在漂浮種植板上進行水培，雖然這種方法簡單，但利用率不高，而且一些雜食魚類會有啃食根系的問題，需要用篩網(wǎng)保護根部，這樣比較麻煩，而且養(yǎng)殖面積小，效率不高，魚的密度也不應該太大。

       水產(chǎn)養(yǎng)殖排放的廢水先通過硝化濾床或過濾，一些生物量大的瓜果類植物可在硝化床上培養(yǎng)，加速有機濾料的分解和硝化，經(jīng)過硝化床過濾的相對干凈的水作為營養(yǎng)液循環(huán)到水培蔬菜或霧培蔬菜生產(chǎn)系統(tǒng)中，蔬菜的根系吸收由水循環(huán)或噴霧提供，被蔬菜吸收后返回養(yǎng)殖池，形成封閉循環(huán)。